Ao longo de sete capítulos, apresentam-se dados de realização física ( candidaturas e aprovações) e financeira (execução, pagamentos, fluxos financeiros com a CE), tendo em conta as dimensões temática, regional e setorial; informação sobre o cumprimento das regras comunitárias; alterações à implementação do Programa; ações desenvolvidas em termos de acompanhamento e avaliação e ações de divulgação e publicidade realizadas ao longo do ano, sendo igualmente apontadas perspetivas para 2013.
Este relatório é ainda complementado por um segundo volume dedicado aos Sistemas de Incentivos do QREN, com enfoque na análise temática de algumas áreas determinantes para a prossecução dos objetivos da competitividade, como sejam I&D e Inovação o Empreendedorismo ou a Internacionalização.
A apresentação anual do Relatório de Execução e respetiva divulgação constitui uma das competências da Autoridade de Gestão do Programa e tem como objetivo a prestação de contas à Comissão Europeia, aos membros da Comissão de Acompanhamento e ao público em geral.